Ứng dụng kỹ thuật MLVA trong phân tích dịch tễ học phân tử các chủng vi khuẩn Shigella Flexneri thu thập được từ các vụ dịch tiêu chảy trong giám sát và điều tra dịch tễ học tại miền Bắc Việt Nam từ năm 1995 đến 2016

Tóm tắt

Nghiên cứu nhằm mô tả kết quả ứng dụng kĩ thuật MLVA trong phân tích 26 chủng Shigella flexneri được thu thập từ các vụ dịch tiêu chảy tại các tỉnh phía Bắc Việt Nam,1995 - 2016. Kết quả xác định có ba kiểu huyết thanh (2a, 2b và 3a) trong đó kiểu huyết thanh 2a chiếm ưu thế. Kết quả phân tích bằng kỹ thuật MLVA xác định S. flexneri là tác nhân chính gây ra dịch tiêu chảy lần lượt xảy ra tại Sơn La, Điện Biên, Yên Bái và Cao Bằng trong các năm 2012, 2014, 2015 và 2016 và mối tương quan giữa mối quan hệ di truyền và kiểu huyết thanh trong các chủng nghiên cứu; tổng số 26 chủng S.flexneri được phân biệt thành 16 kiểu gen MLVA khác nhau, hầu hết các chủng gây dịch thuộc týp huyết thanh 2a chiếm trên 92% và được xếp vào 14 kiểu gen MLVA. Chỉ có một kiểu gen MLVA cho mỗi kiểu huyết thanh 2b và 3a lần lượt được phân lập ở Sơn La và Cao Bằng. Kết quả cũng cho thấy hầu hết các chủng phân lập trong cùng một kiểu huyết thanh đều có mối quan hệ về thời gian và địa lý. Các nhóm phân lập này cũng có nguồn gốc địa lý tương tự. Hơn nữa, nghiên cứu này cho thấy MLVA có thể được sử dụng như một phương pháp hữu ích để xác định kiểu gen của Shigella trong điều tra dịch tễ học.