Đặc điểm di truyền của chủng Klebsiella pneumoniae lâm sàng kháng phổ mở rộng phân lập tại Thành phố Hồ Chí Minh

Tóm tắt

Klebsiella pneumoniae thuộc nhóm tác nhân gây nhiễm khuẩn bệnh viện hàng đầu. Việc lựa chọn kháng sinh điều trị hiệu quả trở nên nan giải khi vi khuẩn tiếp nhận và kết hợp nhiều cơ chế trở thành chủng kháng phổ mở rộng (XDR), chỉ còn nhạy cảm với một hoặc hai nhóm kháng sinh. Chúng tôi tiến hành nghiên cứu nhằm mô tả đặc điểm di truyền chủng K. pneumoniae XDR lâm sàng PI15KP27 từ dữ liệu giải trình tự bằng hệ thống MinION kết hợp với MiSeq. Kết quả phân tích bộ gene PI15KP27 cho thấy chủng có một nhiễm sắc thể dài 5.247.824bp và ba plasmid vòng có kích thước lần lượt là 222.330bp, 144.138bp và 121.851bp. Ngoài 29 gene kháng tìm được dựa trên cơ sở dữ liệu Resfnder, kể cả gene kháng colistin mcr-1 và carbapenem blaNDM-4, cơ sở dữ liệu CARD cung cấp thêm 14 gene quy định tính kháng liên quan đến cả bốn cơ chế bơm đào thải, giảm tính thấm của màng, tác động đến mục tiêu và bất hoạt bằng enzym. Việc tiếp nhận nhiều và đa dạng gene kháng có sự đóng góp quan trọng của các yếu tố di động như plasmid, yếu tố gắn chèn IS, gene tra, gene cassette. Sự kết hợp của nhiều cơ chế kháng kháng sinh trong chủng lâm sàng này làm báo động về khả năng lây lan của vi khuẩn K. pneumoniae
XDR trong các cơ sở y tế.